微生物遗传与工程生物学摘译自: https://doi.org/10.1002/anie.202315093
CRISPR/Cas9 系统是一种功能强大的基因组编辑工具,可精确编辑基因组序列。Cas9蛋白可在3碱基原位相邻基序(protospacer-adjacent motif,PAM)和单链向导RNA(single-guide RNA,sgRNA)的招募和引导下识别特定的目标双链DNA。
在基因治疗领域,已开发出三种CRISPR/Cas9 系统递送模式,包括 sgRNA/Cas9编码质粒、sgRNA /Cas9-编码mRNA 和 sgRNA/Cas9 复合物。
其中sgRNA/Cas9 复合物无需在细胞内进行转录或翻译。但在递送复合物时,Cas9 蛋白容易失活。
近日,来自中国科学院国家纳米科学中心的丁宝全团队在《Angewandte Chemie》杂志上发表研究“A DNA Origami-Based Gene Editing System for Efficient Gene Therapy in Vivo”以DNA折纸这一概念为出发点,构建了在体外能以一锅法进行包装、在体内能自发靶向和释放Cas9复合物的基于DNA的Cas9递送系统。
细节如下:
研究在保证选用的Cas9复合体功能完整的情况下设计了DNA折纸所需的单链DNA,随后通过95℃缓慢退火至20℃获得了二维结构的DNA折纸材料,去除多余的辅助链后,将纯化的 DNA 折纸材料与多条功能链(包括富含 PAM 的 单链DNA、DNA适体(用于靶向特定器官) 和 HA-ssDNA(用于在细胞内释放Cas9复合物))混合,形成表面富含 PAM 区域的 DNA 折纸材料(DNA origami template with the PAM-rich region on its surface,DOPAM)通过 PAM 引导的组装和预先设计的 DNA/RNA 杂交(cargo-loaded DNA origami ,DOPAMRC)将 sgRNAL/Cas9 募集并加载到 DOPAM 上。载货的 DOPAMRC 接着被带有二硫键的锁定链(locking strands with a disulfide bond ,L-DOPAMRC;该锁定链能被谷胱甘肽水解二硫键,进而释放复合物)卷起。(注:该过程详见文献方法部分)
sgRNAL的由来
随后研究在MCF7肿瘤细胞中测试了DNA纳米递送系统搭载Cas9复合物后的编辑效率,以MCF7肿瘤细胞中的绿色荧光蛋白为靶标,发现L- DOPAMREC 减少了约 75% 对 DOPAMREC 减少了约 50%(区别在于是否添加锁定链)。以PLK1基因为靶标则能显著下调PLK1蛋白的表达水平。
以靶向PLK1基因为例的编辑效果差异图,RpC组为无包裹的Cas9/sgRNA复合物
细胞杀伤效率测试结果显示在L-DOPAMRPC组中,超过75%的细胞能被PI染色(意味着细胞死亡)。流式细胞术对细胞凋亡进行了定量分析,发现经 L-DOPAMRPC(靶向肿瘤相关基因PLK1) 处理的细胞凋亡率约为 70%。在 L-DOPAMREC(靶向 增强型绿色荧光蛋白EGFP基因)组中没有观察到明显的肿瘤细胞增殖抑制,这表明基于 DNA 折纸的递送系统脱靶率较低。以肿瘤相关基因(PLK1)为靶点的DNA折纸基因编辑系统能有效地上调肿瘤细胞的凋亡,下调肿瘤细胞的增殖。
对裸鼠肿瘤移植模型进行肿瘤抑制实验发现L-DOPAMRPC能显著的抑制肿瘤的生长。
综上,研究提出的人工DNA纳米结构(DNA折纸技术)能有效地提升Cas9复合物的靶向递送效率,将为肿瘤治疗和基因组编辑带来便利。
(徐毅诚摘译)
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