合成生物催化剂摘译自:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0958166920301221?via%3Dihub 

  抗生素的发现和发展拯救了数百万人的性命。但是随着多重耐药菌的泛滥,抗生素的研发速度相较于耐药菌的进化速度已经远远落后。因此加速抗菌药物的开发迫在眉睫。

  近日来自比利时鲁汶大学的Rob Lavigne团队在《Current Opinion in Biotechnology》杂志上发表评论文章《Phage-based target discovery and its exploitation towards novel antibacterial molecules》。介绍了从噬菌体基因组中挖掘抗菌化合物的通用策略。该策略基于对噬菌体与细菌的相互作用的认识来发现新型抗菌靶标和新型抗菌化合物。

  在亲代噬菌体利用微生物细胞内的资源合成子代噬菌体时,会表达特定的蛋白持劫宿主的代谢活动,在这个过程中,会产生一些能够抑制宿主代谢过程的蛋白质,通过分析这类抑制蛋白抑制宿主蛋白的关键结构域,并通过化学合成手段合成与这类关键结构域的结构类似的小分子,就有可能发现新的抗菌化合物。

  在2004年的一项研究中,研究者发现来自金黄色葡萄球菌噬菌体上的一个表达框能产生针对宿主结训酶的抑制剂,后经筛选得到了36个能抑制解旋酶对表达框进行解旋的化合物,其中11个在16μg/ml的浓度下表现出针对金黄色葡萄套球菌的抑制活性。

目前来说基于噬菌体的抗菌化合物发掘策略可以归纳为:

1、 发现抗菌蛋白

2、 鉴定抗菌靶标、分析抗菌蛋白的关键结构域

3、 构建与抗菌结构域结构类似的衍生物库筛选可用化合物

发掘流程


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